一是战争本身的残酷性。清军入关是一场大规模的军事征服行动，在战争过程中，无论是古代哪支军队，攻占城池、平定反抗等行为往往会造成人员伤亡。当时明朝残余势力以及各地的反清力量激烈抵抗，为了镇压反抗，清军使用武力强攻，从而导致流血冲突。
二是民族矛盾的因素。清朝是满族建立的政权，在入关初期，满汉之间存在诸多矛盾。汉族的一些士绅百姓对满族统治存在抵触情绪，发起了众多反清复明活动。清朝统治者为了巩固统治，采取了比较强硬的手段，如嘉定三屠、扬州十日等事件，就是这种矛盾激化后的悲剧。这些残酷行为也有通过血腥镇压来威慑反抗力量，以达到稳定统治秩序的目的。