你首先要理清一个思路：
李治是李世民亲点的皇帝，而李治是长孙皇后的嫡子，从血缘与皇位继承等合法性来讲，李治是当之无愧的高宗皇帝；
王皇后作为李治第一任皇后，是李世民亲点的太子妃，自然而然拥有合法性。但是王皇后膝下无子，于是听从长孙无忌的话过继了李治临幸宫女所生的长子李忠，李忠成为皇后的儿子身份转为太子，无可厚非；
武曌成为新一任皇后时，李忠嫡子的身份自然而然随着王皇后的倒台而消失，李忠赶出东宫后被武曌杀害。这正常吗？非常正常。即使武曌不杀，李忠作为废太子且个人无亲无德的结局怎么都不会好。
插一句，李治拥有几个儿子？总共就6个。最初与宫女所生的庶长子李忠，与李治相伴的王皇后没有子嗣；萧淑妃生有1子2女，子李素节被封为许王，最后死于武曌之手；两个公主也随着萧淑妃被打入冷宫而被囚禁，被太子李弘从掖庭救出，由武曌钦点将两位公主下嫁给了两位刺史。最后，庶长女义阳公主因丈夫反武连坐，终身囚禁；宣城公主活到睿宗复辟，颐享晚年。
废太子李忠和许王李素节都是在武曌来到后宫之前所生，随着武曌摆平王皇后与萧淑妃后，后宫就再也没有其他嫔妃，有的只有皇后武曌，以及武曌姐姐韩国夫人和侄女魏国夫人。这俩夫人与李治打过牌，韩国夫人有怀孕迹象后被杀，魏国夫人死于政治斗争。
武曌实行了皇后册封大典，自然而然她的儿子就拥有了嫡子身份。
首先，嫡长子李弘为东宫太子，随后24岁的李弘因体弱而病故。
其次，嫡二子李贤成为太子，因政治斗争失败而被流放巴州，最后被丘神纪所杀；
再者，嫡三子李显成为太子，熬死了李治成功登基。但由于李显滥权在裴炎和太后武曌的合谋下被废，贬为庐陵王；
然后，嫡四子李旦成为皇帝，但李旦无心争权夺利与恐惧武曌的威压，最终选择禅位给母亲，武曌成功登基。
随着神龙政变，武曌退位，中宗复辟。题主所问的问题就在这个时间段：
根据上述所说，你应该明白此时李治的儿子还剩几个？就俩。一是武曌的嫡三子李显，二是武曌的嫡四子李旦。
也就是说，皇位继承人只有武曌的子嗣，而武曌不管是作为李治的皇后，还是武周的皇帝，亦或者是唐朝的太后，都无法改变武曌合法性与法统正规的事实。
为什么？因为武曌称帝是睿宗李旦的禅让，这次的禅让可以说比上古尧舜禹还更有可信度。
那么，从法统上讲，不管是李显还是李旦，亦或是李隆基甚至更后面的皇帝，他们都是李治与武曌的一脉。
否定武曌会出现非常多的问题。
其一，皇帝认同（法统）。武曌建立的武周是不是李唐？史学家公认是但当时其他李家宗室认为不是，所以认为不是且有动作的都死了。而作为武曌嫡子的这皇帝如果认为武周不是李唐，那他作为武曌的儿子那他登基代表的是武周还是李唐？那武曌作为太后是武周的太后还是李唐的太后？所以说，从正常思路上讲，后续皇帝必须承认武曌的武周其实就是李唐；
其二，朝臣认同（政权）。武周时期，虽然大杀朝臣，但是别忘了，武曌还是知人善用，就比如最著名的狄仁杰就是最明显的保李派，尤其是神龙政变的5王都是狄仁杰退休前向武则天举荐的大臣。也就是说，从武则天当政期间，朝廷的阁老（宰相）比如狄仁杰并没有认为李唐灭亡，而是认为武周不过是李唐改了个叫法而已，但他还是希望能恢复李唐神器，也就是嫡子当皇帝。你可能想说，举这个例子是什么意思？意思就是那些狄仁杰后续的学生们当政，为了维护自己恩师狄仁杰的颜面，也不会内涵甚至刻意地去摸黑武周不是李唐；
其三，百姓认同（民心）。这一点是很好理解的，百姓从来不关心谁当皇帝，只要谁能对他们好，他们就认为谁是好皇帝。武周时期，虽然政治内乱频繁，但武曌对于底层百姓与低品官员都有很好的补贴，轻徭役低税收。因此，现在的皇帝对百姓好同时得知她是一位女性的时候，百姓们应该更为称赞；
其四，传统孝道（文化）。这一点也很好理解，新皇登基最重要的就是建立属于自己的威信，以至于稳定朝政和江山。那么最简单的就是大赦天下与普天同庆，这么做的目的就在于提升皇帝个人在百姓心中的好感度。而儒家思想中的孝道正是最简单体现皇帝个人思想品德的方式，只要对自己的母亲好甚至让别人认为好，那么你这个皇帝至少是仁孝皇帝。
综上所述，武则天的地位不会被否定，因为社会各界除了那些死在武则天的鬼魂不同意以外，其他人都不会。
那么为什么武则天死后，武氏家族没有被清算？
因为这群人从武则天登基开始，就是毫无本事的墙头草。
神龙政变后，中宗表面掌握着朝政，实际上权力在韦后和她的女儿安乐公主手上（李显妥妥绿毛奴）。
虽然武则天退位，但武氏家族不少人身居高位，现在群龙无首，韦后收编了他们，此时，武氏家族成为韦后的爪牙；上官婉儿成为李显的妃子。
韦后为了重现武则天的光辉，和安乐公主合谋杀死中宗李显，在准备篡改遗诏时，在李旦的三子李隆基与太平公主的合谋下，发动了唐隆政变，杀死了韦后安乐公主在内的策划人以及亲信，这时候武氏家族死掉了一些。
于是，睿宗李旦复辟，李隆基被封为太子，太平公主由于功劳太大，被封为皇太女，权利甚至高过太子。。。正当太平公主逼自己哥哥李旦时，李旦宣布退位传位给太子李隆基，李隆基在后续与太平公主的斗争中胜出，大批太平公主的亲信被连坐，这里面又有武家人。
唐玄宗登基，由于他与武家人毫无瓜葛，也没有利益往来，自然而然那些存活下来的武家人不会身居高位，也只能慢慢地成为隐形人。
既然对朝政失去了往日的威胁，自然而然就不需要赶尽杀绝，毕竟他们也算是自己旁支的后代。和武则天杀李氏家族一样，杀的只是不听话且活跃于反抗的族人，那些老实巴交的也没必要杀，让自己名声更差。
其实，武氏家族有不少人是赐姓，并没有血缘关系。
