因为“义军”真的会在攻克每一座城市后，突突城内的每一个满人……
而且这事儿南方义军特别熟，因为他们已经有“长毛”老哥们帮忙打过样了，清政府不交政权，义军们不建议再来一次屠满浪潮，大不了一个城市一个城市啃呗，就看民族主义思潮宣传开来以后，满人心慌不慌吧。历史证明，民族主义一旦崛起，汉人是真的可以顶着高烈度伤亡硬抗的，更别说人数众多了，满人才有几个人啊？
太平天国期间，立志要肃清“清妖”的洪秀全在其活动区域内强调严格的种族区分和对抗，凡是太平军所占领的地方，军队都有义务把其中的旗人全部清理掉，杨秀清对此也是拍手称快。
这主要是因为清朝的统治者都是满族，而清廷为了维持统治、安排八旗及家眷住所、强调满人旧俗，就在全国的各处重要城市内或是在教徒要道旁都安置刻意制造民族割裂的驻防城，这样的地方就被称为“满城”，限制其他民族的人进入，其中比较出名的满城有西安满城、潼关满城、宁夏满城、凉州满城、太原满城、广州满城、江宁满城、京口满城、杭州满城等。
而这样的地方都是太平天国要肃清的地方，在洪秀全的领导下，与清军有着天大仇恨的太平军开始执行残酷的种族清洗政策，屠灭各处的旗人，即使其主动投降，愿意为太平军卖命也不能逃脱。而由于旗人的风俗习惯和语言习惯与汉人和其他民族不同（朝廷要求的），因此还是很好分辨出来的，一般不会错杀。
因为太平军的这一政策不仅是对清朝统治者的直接报复，更是对种族歧视和压迫的极端反抗。所以太平军在占领各地城市后，往往会迅速对当地的旗人进行搜捕和处决，有时甚至会进行大规模的屠杀。
这种极端的种族政策，加大了太平军的统治难度，也有许多无辜的旗人惨死，很多旗人知晓无法活命后，都是拼死抵抗，这种种族清洗政策也加剧了太平天国与清朝之间的敌对和冲突，使得战争更加残酷和激烈，但太平军并未取消这一政策，一直坚持实行，将自己占领区内的旗人杀戮殆尽，数十万人消失，仅有少量旗人改名换姓之下躲过一劫。
1853年，太平军攻下九江、芜湖，在城破之后大肆屠杀清廷官员和旗人，据太平天国史料《粤匪大略》载：
“满洲城，杀戮再惨，男妇幼孩，不留一人。”
只在1853年3月，仅7天时间，南京城内自江宁将军祥厚以下就有4万多旗人男女老幼被太平军所杀，南京城内的旗人几乎一个不剩：
“旗民四万余（包括女人），童子三千人，悉数被戮，无一留者，盖以为汉人复仇也。”
“顺水扬帆下游，攻打安徽省，既克。直打江南省，名号南京，十日之间，即破该城，所杀汉满妖官妖兵数万。”
美国人亨特在中国生活了很久，他也在自己的书中记载了太平军对旗人的屠杀:
“他们进入南京，对那里的满洲驻军连同家属进行了冷血的大屠杀，杀了老老小小近 25000人。”
1860年5月，太平军东征苏常地区，仅用了一个月左右的时间，就将除了上海以外的苏南地区中所有旗人找出杀死。
1861年12月，太平军二攻杭州，这次军事行动打下了杭州满城，太平军将领随即命令部下，将城内旗兵全部杀死。
而经过多年的“清理”，整个太平天国占领区和广大南方地区的旗人数量都降到了一个极低的水平，即使在太平天国运动失败以后，清廷虽然也曾大肆报复太平军，进行大规模屠杀，还特意从其他地方另调旗人驻防南方，但是其数量没有了之前那么多，这也是之后反清起义多从南方开始的主要原因之一，因为清廷对于南方的掌控力已经大不如前了，等于是太平军为后世起义军打下了坚实基础。
而等到辛亥革命爆发后，南方的旗人也迎来了一次屠杀，当时革命军在起义过程中和成功后，都有大肆屠杀旗人的记录，当时各个脱离朝廷的省份都发生了规模不等的屠杀。
从革命首义的武昌最先开始，到后面的西安、荆州、杭州、广州、南京等地都曾发生过针对旗人的屠杀事件，当时仅西安地区，就有超过两万多旗人及其家眷都被屠灭，但好在革命军并没有像太平天国那样嗜杀，还是有许多旗人活了下来。
小知识：连蒋介石都曾带着100多人的步兵，靠着手枪、步枪和土制炸弹，就打下了杭州满城。
而针对旗人的屠杀也再一次震惊了清廷，在镇压革命无果后，清朝的统治者们必须考虑自己以后的日子了，因此这也一定程度上促成了清朝皇帝退位。
