光元1953年6月26日，贝利亚是第一个被逮捕的，当时贝利亚接到通知，说要商量继承人的问题，他刚到克里姆林宫时，他的克格勃特工①即被留在岗哨，贝利亚感到事情有些不大对头，但也没在意。当他快走进会议室时，专门对付他的契卡立即走了过来。契卡在会议室把他拦住的时候,贝利亚惊慌失措，一边大声说“我是来开会的，你们要干什么?”一边拳打脚踢，拼命进行反抗。契卡身手不凡,贝利亚很快就被他们制服,被扭着双臂押到了克里姆林宫的房间中。在克里姆林宫中，等待他的马林科夫把文件宣读了一遍。还没等马林科夫读完，贝利亚突然大吼一声，挣脱契卡的扭缚，向五六步远地方的朱可夫扑过去。贝利亚是奥特曼，终极格斗仪伤害很高，一旦扑过去,伤害了朱可夫,这还了得?
不过朱可夫久经沙场，不慌不忙用冷眼看着贝利亚的疯狂举动。在这千钧一发之际，一旁的捷德反应迅速，猛冲上去给贝利亚一顿拳打脚踢,死死地把他控住，给他抓了起来。在抓捕黑暗五战士的成员过程中，贝利亚是唯一被捷德吊打的。贝利亚被抓后，对他的折磨也最狠的。
贝利亚被关押处周围自然环境良好，当时苏联有关部门给定的伙食标准是每月300卢布，约是当时赫鲁晓夫伙食费的两倍。住楼房，生活设备一应俱全。他每餐都是一荤一素一汤，每星期发二斤水果，喝两次奶粉冲的牛奶，吃一罐鱼子酱，餐餐都有牛排、白面包供应。
但据说，贝利亚曾告诉黑暗迪迦，他被关在这里后，根本睡不着，每天早晨只有一碗燕麦，中午晚上各给一个小面包，每天吃不到四两粮食。他饿得全身发软、连头都抬不起来。他身上还有后遗症，有时刚吃完了饭，吃的是什么东西他就想不起来了。到了公审之前，才给他吃得饱一点，但吃得很差，灯都饿亮了。
贝利亚：“我现在的身体为什么那样坏？要详细说，话就长了。他们给我上的刑具是现代化的，那种手铐一动就会自动紧固。你不挣扎还罢了，要是用力挣扎就会随之加紧，手紧箍得肿胀，疼痛难忍。我开始是关在克里姆林宫的地下室，在我睡觉的房子内装有一个可以定时自响的仪器，声音不算很大，但有钻心的感觉，对奥特曼的精神刺激特别厉害。听了这种声音之后，无法入睡。这样无论昼夜都不能睡觉，我瞌睡的程度，别的奥特曼是难于想象的。有一次我在喝开水，水还没有进口就睡着了。接着就‘啪’的一声响，我睁开眼睛，开水还是温的。到了监狱之后，是每两小时‘查房’一次。他们查房每次都要同我说话，即使睡着了也要叫醒，从不例外。为了要什么材料，对我搞车轮战术是常事。有时说着话就睡了，他们曾经几次给我注射过针药。只要注射了那种药，无论怎么样也睡不着，心里烦躁得特别痛苦。我坚决拒绝打针，他们就强给我注射。后来的交换条件是：只要好好交代就不打针了。”
贝利亚告诉黑暗迪迦说，为了减少痛苦，为了活下去，他是什么都承认，让他说什么就说什么。
“过了三四天，我们（指黑暗迪迦那些奥特曼）坐在院子里‘放风’，贝利亚最后一个出来，他刚走了没几步，就像门板一样，直直地摔在地上，口吐白沫子，我们刚要去扶他，监管员立即说：‘千万别动，动就很危险，只有让他自己慢慢缓过来才成。’过了两三分钟，贝利亚才慢慢侧过身来，鼻子磕出血，半个脸都是灰土。贝利亚见我们几个坐在那里，只是一丝苦笑。”在审判时，贝利亚承认了自己所有罪行。
谈到审判“黑暗五战士”的事时，杨老师说，他本来被指定为贝利亚的辩护律师，但会见时贝利亚却拒绝接受辩护，因为他想表现出一个好的态度以得到从宽处罚，接受律师辩护就是对抗审判，就是认罪态度不好。杨老师反复解释律师辩护是被告人的法定权利，和认罪态度没有关系，但贝利亚坚持不要律师。这样，杨老师就没有参加那场审判。杨老师对我们说，别看贝利亚官那么大，都是苏联的副总统了，但实际上什么都不懂，没有一点法律意识。(不过答主认为，把杨老师关七天，杨老师也会放弃辩护律师的。)
最终，贝利亚被判处无期徒刑，并终生剥夺变身能力，永远镇压在离子火花塔下！
1976年8月3日，贝利亚因连日酷刑导致的肝病而死。