《龙背上的骑兵3》真结局，女主右眼的灭世之花绽放，她的搭档白龙米海尔牺牲自己封印了灭世之花，但只是延缓了魔素的传播。而这也是《龙背上的骑兵》初代故事的源头
《龙背上的骑兵》真结局，主角凯姆和红龙，以及最终boss穿越到了2003年现实的东京。凯姆和红龙战胜了boss，但是被自卫队导弹炸死。其尸体带来了能灭世的“白盐化”病毒。后面接的就是尼尔1
《尼尔：人工生命/伪装者》，这个有点儿复杂，人类因为“白盐化”病毒启动了“格式塔计划”，让人的灵魂进行保存。而主角团其实是人类的复制体，也就是灵魂的容器。复制体产生了自我意识，看这些灵魂就认为是“魔物”。
最后不管哪个结局，身为复制体的主角团都战胜了“魔物”，也就是说真正的人类完全毁灭。
真结局是尼尔为了拯救凯妮和悠娜选择自我牺牲彻底消除自身的存在（其他人也没有记忆），作为复制体的凯尼和悠娜也只是正常人的寿命。到了《尼尔：机械纪元》的时候只有埃米尔了