这的问题答案肯定是“历史要为现实服务”，其实即便是《清代国家统一史》或者李治亭的《清史》对此的评判差不多到没有积极意义为止，农民军抵抗清军差不多也是一个水平的位置。只有吴三桂和郑经是要拉出来骂的，什么割据分裂，以武谋独。其他对“南明”抗拒统一的说法只多见于网络中的特定板块。
譬如刚才我已经荒漠化的回答里提及
然后是沈逸的引用
赖清德只字未提郑成功对台湾作出的巨大贡献，罔顾明郑与祖国大陆的密切关系，谬称其建立了“王国”，完全是不符史实的无稽之谈。
知乎东宁王国随便一搜
首先郑经在三藩之乱前就已经放弃明朝改为自立了，称“东宁王国”。所以满清打的不是明郑。明郑是郑成功，不是郑经。 郑经自立后明确声称“台湾远在海外非中国版图”。
大多数人对历史是缺乏兴趣的。
而抗战时期，激励民族精神，自然而然要忆古，满清自然而然的就不重要了。自然南明会获得一些更高的评价或者是同情。