《金陵十三钗》的突出问题，是对国军进行了美化，以至于使整个历史氛围变得虚假，并且使后续情节变得无法理解。在影片中，佟大为饰演的国军李教官，率领一小队士兵，不仅装备精良，战术高超，而且还充满了舍生忘死的英雄主义气概，在和日军作战时，简直以一当十。
这就带出了一个问题：南京保卫战开始时，守城的国军约15万人，攻城日军约5万人。倘若国军如导演张艺谋表现的那般神勇，南京为什么只守了十几天就陷落了呢？按照一般的军事规律，攻城兵力至少应该是守城兵力的两至三倍，也就是说，守卫南京的国军至少应该能够顶住30万日军的进攻，但为什么连5万日军都阻挡不住呢？如果国军能够守住南京，则自然不会发生南京大屠杀，难道不是吗？
《南京照相馆》则直面了这个问题。在日军的猛烈攻击下，守卫南京的国军开始溃退，但城门上的国军督战队禁止他们后撤，用重机枪向蜂拥而至的国军溃兵猛烈扫射。溃退的国军部队，为了求得逃生的机会，向国军督战队发起反冲锋，死伤惨重。这组镜头虽然只有几十秒，但至关重要，因为它交代了整个时代氛围：国军士气已经完全瓦解，南京保卫战已然溃败。
影片的另一个情节也非常重要，做为邮递员的苏柳昌（刘昊然 饰），被他所属邮政所撤离车辆甩下，而邮政所车辆开出不远，也被日军炮火掀翻。苏柳昌只能自己决定是继续逃命，还是留下来等待无法预知的命运。这意味着，在军事崩溃的同时，国民政府的民政系统也崩溃了——南京市民既没有人保护，也没有人组织，一盘散沙，只能听任武装到牙齿的占领军蹂躏与宰割。
《南京!南京!》的突出问题，则是美化日军。《南京!南京!》里出现的人物很多，有国军，有普通市民，有妓女，也有拉贝这样值得尊重的外国人，但真正贯穿始终的，却是屠城队伍当中的一员：日本小军官角川。
在导演陆川的镜头里，角川接近“完美”：洁身自好、对慰安妇百合子的爱情纯真执着，就连枪杀姜淑云，也是为了使她免遭凌辱，影片的结尾，他更是毅然放走两个中国人，然后以自杀来完成了灵魂救赎……于是，角川就成了大屠杀中最令人感动的人物，以至于有人建议，把片名改为《一个日本好人和一座叫做南京的城》，观众几乎要不得不为角川之死落泪了。
但问题在于，如果日本军人居然如此善良，那为什么又会发生空前惨酷的南京大屠杀呢？
另一个问题是，如果日本军人居然是南京大屠杀的最大受害者，难道被屠杀的中国人反而是有罪的吗？并不是说在几百万侵华日军中，不存在极个别的类似角川这样的人物，而是说角川没有任何典型性，不能做为一部以大屠杀为主题的电影主角——你屠杀了我们，还要我们同情你因为参与屠杀而使心灵受到伤害，天下哪有这样的道理？