鸡蛋不是不能清洗，而是清洗后还要经过适当的处理后才能保存，比如“无菌蛋”的生产过程就经过了清洗。但是家庭简单的清洗过程反而不利于鸡蛋的保存。
自然界中，动物早就进化出了一套安全体系保证卵的安全。鸡蛋的蛋壳比你想象的要复杂的多。为了保护内部成分免受微生物腐败和运输冲击的影响。蛋壳的四层主要包括乳突层（mammillary layer）、栅栏层（palisade layer）、表面晶体层（ surface crystal layer）和角质层（cuticle）。
乳头层约占蛋壳总厚度的三分之一到五分之一。它由许多不规则的圆锥形突起（乳头）组成，乳头的顶端嵌入外壳膜中，不规则的基部融合在一起形成栅栏层的基础 。乳头层具有锥形结构，其特殊特征会影响其厚度、强度和与壳膜的附着 。乳头层有助于提高壳的整体强度。蛋壳内有数千个（约10,000个）微小毛孔，使鸡蛋与其周围环境之间能够进行气体和水分的交换。
蛋壳角质层是一层蛋白质层，可溶于水，主要由糖蛋白、脂质和脂肪组成。角质层在产卵前1.5至2小时内在壳腺中合成，可以密封蛋壳的这些毛孔，减缓水分流失，防止有害细菌进入鸡蛋。
鸡蛋角质层的外观会因母鸡的品种和鸡蛋的颜色而异。以下是不同类型鸡蛋上的角质层简要概述：
白色鸡蛋：白色鸡蛋上的角质层可能很难看到，但它可以使蛋壳略微有光泽或闪亮的外观。
棕色鸡蛋：棕色鸡蛋上的角质层会使它们看起来更暗、更有光泽，甚至略带红色。
蓝色/绿色鸡蛋：蓝色或绿色鸡蛋上的角质层可以增强其虹彩效果，并产生引人注目的几乎金属光泽。
当鸡蛋被清洗后，这层角质层被洗掉，则更容易造成鸡蛋的入侵。
那么清洗后有什么办法保证细菌不再入侵呢？涂蜡、或者复合涂层、或者矿物油。
在“无菌蛋”的生产工艺中：
1、首先采用专业的清洗设备和消毒剂对鸡蛋进行清洗和消毒，去除表面的污染物。
2、采用紫外线消毒或巴氏杀菌等方式，进一步降低蛋壳表面的细菌数量。
3、经过巴氏杀菌后，鸡蛋上会涂上一层食品级蜡，以保持新鲜度并防止环境污染。
因此鸡蛋可以清洗，但是清洗后需要涂上保护层去替代被洗掉的角质层，并在低温环境下保存才行。