总结版：
1、肖某违规问题及处理：
- 问题：术中违反安全制度、中断手术危及患者安全；婚姻存续期间与他人存在不正当关系，严重违反医德医风。
- 处理：中日友好医院开除其党籍、解除聘用关系；北京市卫健委吊销其医师执业证书，并给予五年以上禁止从事医疗卫生服务的处罚；涉事医院被责令整改、警告并罚款。
2、董某莹违规问题及处理：
- 问题：2019 年报考北京协和医学院 “4+4” 试点班时伪造课程学分，入学资格造假；博士论文抄袭剽窃（重复率超 20%），多篇论文存在不当署名、重复发表等学术不端行为。
- 处理：北京协和医学院撤销其毕业证书、学位证书；北京市卫健委撤销其医师资格证书、医师执业证书。
3、北京协和医学院 “4+4” 试点班问题
- 暴露出录取资格审核、临床实习管理、论文审查及思政教育等环节存在方案不严密、管理不严格、落实不到位等问题，目前北京协和医学院正深入整改；国家卫健委联合教育部对试点班进行全面评估，督促改革完善。
4、后续调查与整治
- 调查组将对相关单位及人员开展深入调查，严肃追责问责，调查结果将向社会公布；
- 国家卫健委将在全国卫生健康系统开展医疗质量安全、医德医风专项整治，强化行业规范。
